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SNP検出ソフト
エスエヌピースポット エスエヌピースポット
バージョン1.0 / Windows Mac OS X Hybrid
 機能説明 Tech Specs


本製品の主な機能をご紹介します。

各種データのインポート

シーケンサの出力ファイル(SCF形式、ABI形式)をサポートしています。マルチFASTA形式、フラットファイル形式などのテキストファイルからもインポート可能です。

対応ファイル

  • SCF形式
  • ABI形式
  • Genbank形式
  • FASTA形式
  • テキスト形式
【 各種データのインポート 】
各種データのインポート
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アライメント(整列)

インポートした配列を、Reference Sequenceに対してアライメントを行います。

【 アライメント(整列) 】
アライメント(整列)
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SNP検出

アライメントした配列のヌクレオチドから、自動でSNP候補部位を検出することができます。混合サンプル、倍数体のDirect PCR産物の配列にも対応。各SNPのアレルの頻度を棒グラフで表示します。

【 SNP検出 】
SNP検出
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プライマー設計

検出したSNP用にプライマー候補を抽出することができます。

【 プライマー設計 】
プライマー設計
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解析結果のタブ区切りテキスト形式での出力

【 SNP Report 】
SNP Report
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【 Primer List 】
Primer List
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