製品概要

安定同位体標識法を用いた相対定量をサポート‼

質量分析計を用いた安定同位体標識法によるタンパク質の網羅的発現変動解析は、従来の手法に比べ煩雑な処理が減少するため効率的です。しかし、大量に生み出されるマススペクトルデータを分析し、検証することは簡単ではありません。

TWIPは、相対定量分析の結果を検証する際に視認性をよくすることで、次の段階であるMS/MS解析やディファレンシャル解析を行いやすくします。

TWIPでの解析フローイメージ

解析の具体的な流れは、以下のようになっています。

TWIPでの解析には、モノアイソトピックピークのみを抽出処理した定量分析に用いるファイル群(定量用ファイル)と、測定データを表示するために用いるファイル群(表示用ファイル)を利用して行います(表示用ファイルは必ずしも必要ではありません)。

各ファイルのm/zと強度を読み込んだ後は、m/zをもとに連続しているウェルのピークをグループ化し、一対の安定同位体試薬の質量差で規定されるピーク群の強度比(相対定量比)を算出するところまでをワンステップで行うことができます。 あとはフィルターなどの機能を使ってMS/MS解析対象のピークを探索し、ペプチド断片の詳細を解析するだけです。

本製品は、(株)島津製作所との共同開発により作られ、同社開発のNBS試薬を用いた実験解析系をモデルとしています。他の実験系での対応等、詳細に関しましてはお問い合わせください。

主な特長

シンプルな画面構成

マススペクトルと定量結果が同一画面上に表示され、マウス操作で相互に連動させることが可能です。

解析は1ステップで開始可能

データを読み込んだ後、1ステップですぐに解析が始められ、解析自体も数秒※ で完了します。

解析のための設定画面

※ 対象データによっては、数秒以上の時間がかかる場合もあります。

ペアピークを強調表示

一対の安定同位体試薬(Light、Heavy)を用いた混合試料から得られるマススペクトルを解析し、色分けして表示します。その際、もとのスペクトルを表示用データとして定量用データと重ね合わせて表示することができます。これにより、定量用ピークと測定ピークの比較が簡単に行えます。

複数ウェルの解析が可能

読み込まれた複数ウェルのデータを一括で解析し、グループ化を行います。ペアピークの強度比はもちろん、解析結果についても複数ウェルの情報を表示します。

ウェルマアップウィンドウ(左)、2Dマップウィンドウ(右)

フィルタリングによる絞込み

フィルタリングによって、例えば発現量の差が大きいペプチド断片のペアピークだけを効率よく抜き出すことができます。

NBS試薬に対応

株式会社島津製作所開発のNBS試薬を用いた相対定量分析に最適化されています。

必要システム

項目	管理用マシン
対応OS	Windows 2000/XP/Vista
メモリ	最低512MB、推奨1GB
ハードディスク	50MB以上※1
対応ブラウザ	–
その他	CD-ROMドライブ (本ソフトウェアインストールのため) USBポート※2

※1 入力、出力ファイル等の容量は含まれません。
※2 本製品ではプロテクトキーによるユーザー管理を行います。そのため、ソフトウェア実行時に、プロテクトキーを接続するUSBポート1個が必要になります。

価格・購入方法

製品の購入方法、価格、導入検討など、製品全般に関するお問い合わせにつきましては、下記までお問い合わせください。

開発元

株式会社ダイナコム
千葉県千葉市美浜区中瀬2-6-1
WBG マリブイースト25階
Tel : 043-213-8131
Fax : 043-213-8132