SNPデータ解析

SNPデータの統計解析でお困りの方へ

サービスの内容

各種解析ツールを用いたSNPデータの受託解析

お手持ちのSNP解析データの統計解析を以下の流れにてご提供いたします。

SNP解析システムの受託開発

動作環境や搭載する機能等につきまして、ご要望に応じたシステムを構築いたします。お気軽にお問い合わせください。

SNP疾患関連解析ソフトの販売

SNP疾患関連解析のソフト SNPAlyze(スニップアライズ)を販売しております。 無償のお試し版もご用意しておりますので、ぜひご利用ください。

SNP解析説明資料のご提供

電子書籍 SNP解析入門を販売しております。これからSNP解析を学びたい方におすすめの書籍です。また、SNP解析に関する技術資料を掲載しておりますのでお立ち寄りください。

データ解析の主な内容

解析目的・ご要望をヒアリングのうえ、適切なデータ解析方法をご提案いたします。

解析対象データ
(お預かりするデータ)
ジェノタイピング結果データファイル
(VCF, Excel, テキストファイル形式等)
統計解析
(必要な解析をご選択)
  • ハーディ・ワインベルグ平衡
    (Hardy-Weinberg&#8217s equilibrium : HWE)
  • ハプロタイプ推定
    ハプロタイプ頻度、tagSNP同定
  • 連鎖不平衡解析
    連鎖不平衡値(D, D’, r2)やAIC算出, グラフ作成
  • ケースコントロール研究
    分割表作成(遺伝形式:Recessive, Dominant, Genotype)
    カイ二乗検定, Fisherの正確確率, U検定
    検定統計量, p値, 効果量, AIC, 多重比較補正 等
  • トレンド検定, logistic回帰分析, logistic lasso等
  • マンハッタンプロット
    検定p値, 効果量等のplot
  • 主成分分析
    主成分係数, 寄与率, 主成分のplot(層別化)
  • その他
解析ツール
  • SNPAlyze
  • R
  • PLINK
  • その他

納品物

  • 解析・開発結果物
  • 報告書

※納品物は発注内容により異なります。

重要

  • 本サービスの仕様は予告なく変更される場合があります。
  • 本サービスは研究用途のみを想定しております。
  • 本サービスにより得られた結果が原因となる損失、損害に対して当社は責任を負いかねます。
  • 解析処理過程においてのパラメータチューニングなど、解析結果の品質について最大限の努力をいたしますが、 お預かりするデータセットのクオリティなどの問題で、結果がお客様の期待される結果と異なる場合がございます。
  • 個人情報に関わるデータセットに関しては、匿名化されたデータセットのみ対応いたします。
  • ご依頼いただく作業、お預かりするデータセットについて秘密保持が必要の場合、秘密保持契約を締結致します。

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