次世代シーケンサー(NGS)受託解析

次世代シーケンサーのデータ解析にお困りの方へ
オープンソースソフトウェアを組み合わせて、
研究目的・実験手法に適したデータをご提供!!

次世代シーケンサー(NGS)データ解析サービスの流れ

データ解析の一例

解析目的、ご要望に応じて、データ解析方法を対応いたします。
 

解析対象データ
(お預かりするデータ)
解析対象データは、HiSeq2000, MiSeq, Ion Protonなどの一次解析結果(fastqファイル)および、リファレンス対象ゲノムファイルになります。
解析サンプル例
  • re-sequencing
  • de-novo assemble
  • exome
  • transcriptome
  • ChIP-seq
  • BS-Seq
  • RAD-Seq
納品物例 納品物はデータファイルおよびオプションにより、解析結果データを表示するゲノムブラウザシステムとなります。
  • リード情報(クオリティチェック結果、トリム情報、リード統計情報)
  • マップデータ(マップ結果ファイル、マップデータ統計情報)またはアライメント結果
  • 三次解析結果データ
  • リファレンスへのマップ情報、多型情報の表示システム(GBrowse, JBrowse またはカスタムブラウザ)

解析ツール例

マッピング bwa, Bowtie2, SOAP2, mrFAST, BLAT, RSEM, TopHat
アセンブル Velvet, ABySS, SOAPdenovo, Trinity
SNP解析/
構造多型解析 
GATK, samtools, VarScan2, BreakDancer, Pindel, mrCaNaVaR, CNVnator, Cufflinks, Bismark, Bis-SNP
アノテーション SnpEff, ANNOVAR, Variant Effect Predictor

重要

  • 本サービスの仕様は予告なく変更される場合があります。
  • 本サービスは研究用途のみを想定しております。
  • 本サービスにより得られた結果が原因となる損失、損害に対して当社は責任を負いかねます。
  • 解析処理過程においてのパラメータチューニングなど、解析結果の品質について最大限の努力をいたしますが、 お預かりするデータセットのクオリティなどの問題で、結果がお客様の期待される結果と異なる場合がございます。
  • 個人情報に関わるデータセットに関しては、匿名化されたデータセットのみ対応いたします。
  • ご依頼いただく作業、お預かりするデータセットについて秘密保持が必要の場合、秘密保持契約を締結致します。

お問い合わせ先

サービスの詳細、価格などについては下記連絡先までお問い合わせください。

  • 株式会社 ダイナコム
    千葉県千葉市美浜区中瀬2-6-1 WBGマリブイースト25階
  • TEL:043-213-8131
  • FAX:043-213-8132
  • E-mail:info@dynacom.co.jp