次世代シーケンサー（NGS）受託解析

次世代シーケンサーのデータ解析にお困りの方へ

オープンソースソフトウェアを組み合わせて、
研究目的・実験手法に適したデータをご提供!!

解析目的、ご要望に応じて、データ解析方法を対応いたします。

解析対象データ（お預かりするデータ）	解析対象データは、HiSeq2000, MiSeq, Ion Protonなどの一次解析結果（fastqファイル）および、リファレンス対象ゲノムファイルになります。
解析サンプル例	re-sequencing de-novo assemble exome transcriptome ChIP-seq BS-Seq RAD-Seq
納品物例	納品物はデータファイルおよびオプションにより、解析結果データを表示するゲノムブラウザシステムとなります。リード情報（クオリティチェック結果、トリム情報、リード統計情報）マップデータ（マップ結果ファイル、マップデータ統計情報）またはアライメント結果三次解析結果データリファレンスへのマップ情報、多型情報の表示システム（GBrowse, JBrowse またはカスタムブラウザ）

解析対象データ
（お預かりするデータ）

解析対象データは、HiSeq2000, MiSeq, Ion Protonなどの一次解析結果（fastqファイル）および、リファレンス対象ゲノムファイルになります。

解析サンプル例

納品物例

納品物はデータファイルおよびオプションにより、解析結果データを表示するゲノムブラウザシステムとなります。

マッピング	bwa, Bowtie2, SOAP2, mrFAST, BLAT, RSEM, TopHat
アセンブル	Velvet, ABySS, SOAPdenovo, Trinity
SNP解析/ 構造多型解析	GATK, samtools, VarScan2, BreakDancer, Pindel, mrCaNaVaR, CNVnator, Cufflinks, Bismark, Bis-SNP
アノテーション	SnpEff, Variant Effect Predictor

本サービスの仕様は予告なく変更される場合があります。
本サービスは研究用途のみを想定しております。
本サービスにより得られた結果が原因となる損失、損害に対して当社は責任を負いかねます。
解析処理過程においてのパラメータチューニングなど、解析結果の品質について最大限の努力をいたしますが、お預かりするデータセットのクオリティなどの問題で、結果がお客様の期待される結果と異なる場合がございます。
個人情報に関わるデータセットに関しては、匿名化されたデータセットのみ対応いたします。
ご依頼いただく作業、お預かりするデータセットについて秘密保持が必要の場合、秘密保持契約を締結致します。
解析ソフトのライセンス形態により、ライセンス取得費用を申し受ける場合がございます。

サービスの詳細、価格などについては下記連絡先までお問い合わせください。

個人情報の取り扱いについて
お客様にご提供頂いた個人情報の利用目的は、次の通りです。